Otizmde temel tıbbi patolojik değişikliklerin beyin içinde; sinir hücreleri (nöronlar), ve sinir hücrelerinin sinaps yapıları, sinaps ağ bağlantıları ve sinaptik iletim yolakları ile beyin içinde yerleşmiş ve görevli önemli diğer hücre gruplarının sayı ve görevleri ile ilgili olduğu belirlenmiş ve elde edilen bulgular yüzlerce bilimsel dergilerde çok sayıda makaleler olarak yayımlanmıştır.

Bu bağlamda özel eğitimin esası olan nöral plastisite ve sinaptik plastisite ile daha önceden çalışılmış ve tanımlanmış belirli davranışlar ile beyindeki sinir hücreleri ile sinapsların yapıları, konfigürasyon ve fonksiyonlarını etkileyebilmeyi ve dolaylı yönlendirebilmeyi amaçlamaktadır.

Tıbbi bütüncül yaklaşım ise beyin içinde otizmde görülen ana tıbbi patolojik değişiklilere direkt olarak müdahele edebilmeyi amaçlamakta ve gerekli müdaheleler uygulanabilmektedir. Tıbbi bütüncül yaklaşım ile aynı zamanda beyini içindeki problemleri netice veren yolakların kontrolü ve düzenlenmesine imkan sağlayabilmektedir. Böylece hem beyin içindeki mevcut problemlerin çözüme kavuşturulması hem de bu problemleri doğuran yollar ve yolakların kontrol edilmesi ve düzenlenmesi sureti ile patolojik değişimlerin durdurulması mümkün olmaktadır.

Bütüncül tıbbi yaklaşım merkezi sinir sistemi ve beyin içindeki problemlere direkt olarak müdahele edebilmektedir.