Alerji, vücudun bağışıklık sistemi tarafından besin proteinlerine karşı gösterilen şiddetli bir tepki olup yaşamı tehdit edici ciddi sonuçları olabilir. Gıda intoleransı ise belirli bir besinin sindiriminde besin içeriği veya enzimatik işleve bağlı olarak sorun yaşanılmasıdır. Gıda intoleransı karın ağrısı, ishal, baş ağrısı, sisli beyin gibi semptomlara yol açabilmektedir.

Otizm spektrum bozukluğu olan bireylerde besin alerjileri ve intoleranslarının görülme riski yüksektir. Besin alerjileri ve intoleranslarına bağlı olarak vücutta gelişen inflamatuvar yanıt; uyku, odaklanma ve dikkat üzerindeki olumsuz etkileri nedeniyle otizmli bireylerde agresif davranışlar, hiperaktivite ve tekrarlayan davranışların tetiklenmesine sebep olabilir.