Mikroglia hücreleri beyinde aktive olarak aşırı çoğaldıkları zaman, sinir hücreleri arasındaki sinyal ileti siteminde bozukluklar, sinir hücreleri sinapslarının budanmasında bozukluklar,  sinaptik ileti ve uyarılma sistemindeki dengenin bozularak, aşırı uyarılma veya baskılanma modlarında olması, sinir hücrelerinde ve sinyal ileti sistemleri ile ilgili mikroglia hücrelerinin pek çok görevlerinde ve fonksiyonlarında aksaklıklar ve  bozulmalar meydana gelmektedir. Otizmde beyinde sinir hücrelerinin sinyal ileti sistemlerinde bozukluklar olduğu bildirilmiştir

Mikroglia hücrelerinin sayıca artışları ve hücre tipi değişimlerinin sonucu olarak; otizmde beyinde sinir hücreler ile ilgili sinyal ileti sistemlerinde ileti problemleri, iletilerde gecikmeler ve  bozulmalarolduğu bildirilmiştir.