Otizmde görülen patolojik değişikliklerde bir üçgen karşımıza çıkmaktadır. Üçgenin üst köşesi; Beyin, Nöro-enflamasyon, alt bir köşesi; bağırsak mikrobiyota dengesi ile birlikte iki bariyerlerdeki bozukluklar (bağırsak-beyin ve kan-beyin bariyerleri), alt diğer köşesi de enerji metabolizması; mitekondrilerden ATP sentezi. Bu üç sistem sağlıkta ve hastalıkta birbirleri ile de ilişkilidr.