Mikrobiyota da yer alan bakterilerin sayılarında ve tür çeşitliliğindeki dengenin korunması esastır.

Bağırsak mikrobiyota bozuklukları, mikrobiyota üyesi olan bakterilerde tür sayısı ve çeşitlilikteki dengenin bozulmanın sonucudur. Dolayısı ile de yapılması gereken bozulan dengenin yeniden tesis edilmesidir. Bunun için yapılacak mikrobiyom analizlerinde elde