Son yıllarda Mikrobiyota-Bağırsak-Beyin aksı ve iki yönlü etkileşim ile ortaya çıkan tıbbi sonuçlar ile ilgili çok sayıda bilimsel makaleler yayımlanmıştır.  Mikrobiyota denge bozuklukları ve bağırsak geçirgenlik artışı ile başta beyin olmak üzere sistemler ile olan etkileşimleri gösterilmiş ve açıklanmıştır. Bu etkileşimin pek çok hastalıklar ve tıbbi bozukluklar ile ilişkileri; Örneğin otizmde beyinde görülen patolojik değişiklikleri ile bağırsak mikrobiyotası arasında ilişkiler bildirilmiştir. Beyinde meydana gelen patolojik değişiklikler de davranış bozukluklarını etkilemektedir. Beyindeki enflamasyonun başlatılması ve tetiklenmesi ile bağırsak mikrobiyota içeriğindeki bozukluklar ilişkili olduğu bildirilmiştir.