Beyin önünde iki bariyer vardır 1. Bağırsak Beyin Bariyeri 2. Kan Beyin Bariyeri. Her iki bariyerin sağlıklı olarak korunması; bağırsak mikrobiyota dengesi ile yakından ilişkilidir. Beyin, önündeki iki bariyer ile korunmuştur. Her molekül beyine ulaşmamalıdır, filtre edilmelidir. Her iki bariyerin bozulması beyni kimyasal, biyolojik tehditlere ve risklere açık hale getirmektedir. Bazı moleküllerin ve maddelerin beyine ulaşabilmesi, beyinde istenmeyen pek çok reaksiyonların tetiklenmesine (enflamasyon, nöro-enflamasyon, oksidatif stres yolaklarının aktivasyonları, mikroglia hücrelerinin aktivasyonu…vd) sebebiyet vermektedir ki; bu durum da pek çok hastalık mekanizmalarının açıklayıcı sebepleri olan beyinde farklı patolojilerin görülmesi ile sonuçlanmaktadır.