Konuşma, sosyal etkileşim, bilişsel beceriler başta olmak üzere birçok yeteneklerin merkezi beyinde farklı bölgelerdedir. Beyinde görülen yaygın nöroenflamasyon sonucunda hem oksidatif stress, hem de nitrozamid stres yolakları aktiflenmektedir. Oksidatif stres aktivasyonu sonucunda ise iki önemli ürünlerde artış meydana gelmektedir; 1. Serbest radikaller 2. Reaktif Oksijen Ürünleri (ROS; Reactive Oxygen Species). Gerek serbest radikaller gerekse de Reaktif oksijen ara ürünleri kimyasal toksinler gibi etki ederek; beyinde sinir hücrelerinin hem hücresel yapılarında, hem de fonksiyonlarında birçok zararlar ve bozulmalar ile sonuçlanmaktadır. Nöronların uyarılma sistemlerinde var olan denge bozulmaktadır ki; bunlar otizmde görülen davranış bozuklukları ile direkt olarak ilişkilidir.