İnsan bağırsak mikrobiyotasında her bakteri grubunun farklı fonksiyonları vardır. Histaminerjik mikrobiyota üyesi bakteriler tarafından histamin üretilmektedir. Başlıca; Anaerop sporlu bakteri olan Clostridium spp. ve Entreobacteriacea ailesi üyelerinden olan;  Enterobacter spp., Hafnia alveii, Klebsiella spp., Serratia spp., Escherichia sppBu bakterilerin tamamı veya bir kısmının bağırsak mikrobiyotasındaki sayıları artış göstermesi halinde aşırı miktarda histamin üretimi ve üretilen histamin bağırsakta lokal ve kan dolaşımına geçerek sistemik alerij reaksiyonları tetiklemektedir.

Alerijk reaksiyonların biyolojik tabiatı ise temelde enflamsyon cevabı üzerine bina edilmektedir. Yani alerjinin dış görünümü alerji içi ve esası ise enflamasyon cevaplarıdır.

Bağırsak mikrobiyotasında enflamasyon cevabı aktivasyonu ile ilişkili bakteriler vardır: Başlıca;  Citrobacter spp., Enterobacter spp., Escherichia spp., Klebsiella spp., Providencia spp., Pseudomonas spp., Serratia spp., Sutterella spp.

Bu bakterilerin bağırsak mikrobiyotasında sayıca artış göstermeleri enflamasyonu başlatarak şiddetlendirmektedir. Alerjik reaksiyonlarda histaminerjik mikrobiyota ile enflamasyon tetikleyici mikrobiyota ikisi birlikte çalışmaktadır ki; her iki yolakta görevlli bazı bakteri türleri ortaktır. Yani aynı bakteri türü hem histamin üretiminden hem de enflamasyon cevabından aynı anda sorumludur.

Alerjinin ve onun esası olan enflamasyon aktivasyonun kök nedeni insan bağırsak mikrobiyotasındaki tür çeşitliliği ve sayısal denge bozukluğudur. Alerjik ve akut-kronik enflamasyon ile seyirli hastalıklara yönelik tedavi-takip yaklaşımlarında insan bağırsak mikrobiyota mevcut durum belirlenmesi bozulan mikrobiyal dengenin yeniden tesis edilmelidir.

Bu bağlamda kanıta dayalı, kişiye özgü, bütüncül tıbbi uygulamalar ile çok olumlu klinik sonuçlar alınmaktadır.