İnsan beyni içinde çeşitli sinyallerin iletimlerine aracılık eden, öğrenme, hafıza, algı, idrak, dikkat ve odaklanma, hafıza, hiperaktivite, uyarılma ve baskılanma gibi önemli olan beyin üst fonksiyonlarını direkt olarak etkileyen sinyal molekülleri nörotransmiter denilen aracı moleküller vardır. Bunlar başlıcaları; Asetil kolin, Glutamat, GABA, Glisin, Seratonin, Dopamin, Adrenalin, Noradrenalin. Her birinin beyinde farklı fonksiyonları vardır ve bunların sonucunda da insanların öğrenme, hafıza, dikkat ve odaklanma, duygular ve hareketlerin kontrolü gibi önemli ruhsal ve davranışsal sonuçları direkt olarak etkilemektedirler. Sinyal moleküllerinin beyin içindeki miktarları ve fonksiyonlarındaki bozukluklar direkt olarak sinyal molekülünün temsil ve aracılık ettiği fonksiyonlarda bozukluklar olarak sonuçlanmaktadır.

Otizmli bireylerde beyindeki bu sinyal moleküllerinin seviyelerinde eksilme veya artışlar olduğu, bu durumun da otizmde görülen davranış bozuklukları ile ilişkili oldukları belirlenmiştir.

Buradan hareketle ilgili sinyal moleküllerinin beyin içindeki miktarlarının dengeye getirilmesi ve dengenin de korunması otizmde görülen davranış bozukluklarında azalma, hafifleme ve iyileşmelerin görülmesine kuşkusuz katkıda bulunacaktır.

Bu sinyal molekülerinin çoğu bağırsak mikrobiyotasında yer alan bakteriler tarafından sentezlenmektedir.